你了解我們海巡署嗎?
— 沿革 —
中華民國政府以往的海上相關事權，分散在國防部(海軍總司令部及臺灣警備總司令部)、內政部警政署水上警察局、財政部關稅總局 、國家安全局、行政院農業委員會等單位，各單位透過海岸巡防司令部（前身為警備總部）主導的行政院會報協調工作及情資，但仍因事權不一造成許多困擾，故在1999年提出海岸巡防專責機構的構想。
2000年1月28日，行政院整合國防部海岸巡防司令部、內政部警政署水上警察局及財政部關稅總局八艘大型緝私艦，成立行政院海岸巡防署，將海岸巡防司令部改編為海巡署屬下之「海岸巡防總局」，原內政部警政署水上警察局改編為海巡署屬下之「海洋巡防總局」，並將緝私艦正名為巡防艦，納編成北、中、南部地區機動海巡隊，後期再成立東地區機動海巡隊。移撥初期八艘巡防艦分別為和星艦（CG101）、偉星艦（CG102）、謀星艦（CG105）、福星艦（CG106）、寶星艦（CG107）、欽星艦（CG108）、德星艦（CG109）及潯星艦（CG110），船名分別以當時關稅總局總局長、副總局長等人名諱命名，而英文編號CG為「Coast Guard」海岸巡防署之縮寫，艦上人員為海關隨艦移撥。
2015年6月16日，立法委員邱文彥等提案的海洋委員會組織四法三讀通過，7月1日，總統令，公布《海洋委員會海巡署組織法》。2016年1月8日行政院公告海委會及海巡署組織法於同年7月4日開始施行，惟同年3月21日，立法院通過臨時提案暫緩施行海洋委員會組織法，6月30日，行政院公告暫緩施行。
2018年4月28日，海洋委員會成立後，海巡署調整為該會所屬機關並更名為海洋委員會海巡署，依組織法規定署長由海洋委員會副主任委員兼任。員額編制從目前15,620人減至8,500餘人
我們確保國家及民眾的安全
— 疆界海域的維護 —
1952 - 2018
— 北部分署第一岸巡隊改革 —
- 1952年，中華民國陸軍第五十六師（1929年成立）重整，部分與第一六六團、第一六八團、第一九九團成立「臺北師管區司令部」，部分與陸軍第六十七師併編為陸軍第八十四師，部分改組為「北部地區警備司令部」，駐防桃園縣桃園市介壽路天池營區。
- 1980年12月20日，駐地遷移至臺北縣中和市秀峰營區。
- 1993年3月10日，納編陸軍及憲兵移撥兵力編成海岸部隊改組為「北部地區海岸巡防司令部」，負責北部地區海岸巡防業務。
- 1999年3月18日，國家安全會議提議成立「海巡專責機構」，以統一國家海防事權。
- 2000年1月28日，行政院整合國防部海岸巡防司令部、內政部警政署水上警察局及財政部關稅總局相關海洋海岸事務，成立「行政院海岸巡防署」，原海岸巡防司令部改編為「行政院海岸巡防署海岸巡防總局」，北部地區海岸巡防司令部隨之改制為「行政院海岸巡防署海岸巡防總局北部地區巡防局」，並搬遷至桃園縣觀音鄉（今桃園市觀音區）忠愛莊營區。
- 2018年4月28日，隨行政院海岸巡防署改制為海洋委員會海巡署而改制為「海洋委員會海巡署北部分署」，另原下轄的機動查緝隊改隸新成立的海巡署偵防分署。